Την Παρασκευή 11-8-2017 και ώρα 12:00 στα γραφεία της Ελληνικής Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας στο πάρκο Γουδή έγινε η κλήρωση για τους αγώνες της 1ης και 2ης φάσης του Κυπέλλου Επαγγελματικών Ομάδων 2017-2018.
Ο Παναιτωλικός κληρώθηκε στον 6ο όμιλο με αντιπάλους τον Πανσερραϊκό, τον Εργοτέλη, και την Ξάνθη.
Αναλυτικά το πρόγραμμα των αγώνων
1η αγων. Ξάνθη-Παναιτωλικός
2η αγων. Παναιτωλικός -Πανσερραικός
3η αγων. Εργοτέλης-Παναιτωλικός
Από τον όμιλο προκρίνονται στην επόμενη φάση οι δυο πρώτες ομάδες.